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真核细胞rna提取的实验报告
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一.原理
本方法利用盐酸胍抑制RNA酶,匀浆裂解细胞,采用有机溶剂抽提去除蛋白质。通过选择性沉淀RNA分子去除DNA。
二.方法
1.样品处理
⑴组织样品处理:取新鲜的组织样品称重后,剪碎成约1cm2的组织块直接加入匀浆液中进行RNA提取,或液氮中速冻-70℃保存。
⑵贴壁培养细胞处理:用PBS洗细胞一次,吸干溶液后将培养板快速移至液氮中冷冻后转到-70℃保存;或加入1ml匀浆至培养板中直接裂解细胞,然后将粘稠的裂解液进一步匀浆。
⑶悬浮培养细胞处理:离心收集细胞,用PHS悬浮漂洗再田心收集,若不立即提取RNA,则可经液氮速冻后转至一70℃贮存备用。
2.加l倍体积盐酸胍匀浆液[至准备好的样品细胞中,高速匀浆1min。
3.匀浆液5000g,室温离心10min。
4.将上清移至一个干净离心管中,加入0.1体积的3mol/L乙酸钠(PH5.2),混匀,再加5体积预冷的乙醇,立即充分混匀,-20℃放置至少2小时。
5.5000g0℃离心10分钟沉淀核酸,弃上清液,室温干燥。
6,每个提取RNA的组织或细胞样品中,加入l0~15min盐酸胍匀浆液Ⅱ,搅拌溶解。
7.加入2.5体积预冷的乙醇,立即充分混匀,-20℃至少放置2小时。
8.5000g0℃离心10分钟沉淀核酸,去上清,室温挥发乙醇。
9.按每克组织细胞加5min的比例.分两次加入0.02mol/LEDTA(pH8.0)先加1/2体积EDTA振荡l~2分钟,3000g离心2min.吸出上清.再加另一个1/2体积的EDTA振荡l一2分钟.合并两次核酸溶解液。.
10.用等体积氯仿—正丁醇(4:1)抽提核酸溶液,5000g室温离心l0min,5000g室温离心10min。吸出上清至另一个干净离心管中。
11.加3倍体积lmol/L乙酸钠(PH7.0)混匀,-20℃放置1h以上,此时RNA将选择地沉淀,而DNA仍为溶解状况。
12.5000g,0℃离心20min,沉于管底的是RNA。
13.吸去上清,用4℃预冷的lmol/L乙酸钠(pH7.0)漂洗RNA沉淀。然后20℃5000g,离心20分钟。回收RNA。
14.尽量去除上清液。按每g组织细胞1m的比例加入RNA溶解液(0.2%SDS,0.5%mol/LEDTA,pH8.0)。注意:若有SDS沉淀析出.滴加0.11mol/LNaOH调溶液pH至7.5。
15.加入2倍体积冰预冷乙醇混匀,0℃放置至少2小时,5000g,4℃离心10分钟,RNA沉淀用70%乙醇漂洗,短暂离心后,弃上清,室温干燥蒸发乙醇。
16.用适当小容积DEPC处理过的ddH2O溶解RNA沉淀,加入3倍体积乙醇,
-70℃保存RNA备用。用时.加入0.1体积的3mol/L乙酸钠,混匀,120xxg,4℃离心回收RNA。
三.试剂
1.盐酸胍匀浆液Ⅰ
成分:8mol/L盐酸胍(分子量为95.6),O.1mol/L乙酸钠(pH5.2),5mmol/L2—巯基乙醇,0.5%十二烷基肌氨酸钠
配制方法:取191g盐酸胍.加8.35m13mol/L乙酸钠(pH5.2)和6.25ml0.2mol/L2—琉基乙醇溶液中,再加水至237.5ml,混匀后加12.5ml10%十二烷基肌氨酸钠,振荡混匀溶解。
2.盐酸胍匀浆液Ⅱ
成分:8mol/L盐酸胍(分子量力95.6),0.1mol/L乙酸钠(pH5.2),1mmol/L2
—琉基乙醇,20mmol/LEDTA(pH8.0)
配制方法:取191g盐酸胍,加日.35ml3mol/I。乙酸钠(pH5.2)和1.25ml0.2mol
/L2—巯基乙醇溶液中,再加入10ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)。加水至250ml混匀。
3.乙醇
4.70%乙醇
5.氯仿—正丁醇(4:l,体积比)
6.4mol/L乙醇钠,pH7.0
7.3mol/L乙醇钠,pH5.2
8.RNA溶解液
成分:O.2%SDS.0.05mol/LEDTA,pH8.0
四、说明
提取RNA时,要特别注意防止RNase的污染,所用玻璃器皿均应用0.1%的二乙基焦碳酸盐(diethylpyrocarbonate,DEPC)处理。塑料器材均使用一次性用品,并高压灭菌处理,必要时,也可用0.1%DEPC处理。
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